Academia de copii și juniori a CSM Unirea Alba Iulia este una dintre cele mai importante pepiniere de fotbal din județ, acoperind grupe de vârstă de la U7 până la U19 și participând atât în competițiile județene, cât și în cele naționale. În sezonul 2024–2025, clubul a cucerit titlul la Under 19, Seria 11, confirmând progresul generației tinere, după ce anterior echipa U19 reușise calificarea în faza de play-off a Campionatului Național. Tot în sezonul 2023–2024, formațiile Under 14 și Under 15 au devenit campioane de toamnă în județul Alba. Aceste performanțe subliniază preocuparea constantă a clubului pentru creșterea și afirmarea tinerelor talente, care reprezintă viitorul echipei de seniori și al fotbalului din Alba Iulia.
